明朝崇祯皇帝登基后，权倾天下的大太监魏忠贤被弹劾辞官，阉党覆灭。锦衣卫授命追捕阉党。锦衣卫卢剑星、沈炼、靳一川三人是结拜的兄弟，感情非常好。大哥卢剑星非常希望自己能够升到百户的职位，二哥沈炼暗恋着教坊司的女子周妙彤，三弟靳一川则有着不可告人的过去被人攒在手里。一天，内宫太监赵靖忠秘密找到三兄弟，要他们奉皇命去追杀要出京流放的大太监魏忠贤。一场追杀之后，三人带回了大太监魏忠贤的尸首，本以为凭此大功，三人的夙愿皆可实现。没想到这一切只不过是一个阴谋的开始，三人即将落入更加危险的境地。

明朝中期，流浪剑客李擎苍带着重病的妻子蓝羽儿四处求医，路过一个海边小城发现城中的居民都得了一种怪病，随着李擎苍的调查，一场倭寇入侵的阴谋逐渐浮出水面，随着李擎苍逐步靠近真相，竟得知幕后主使与当年李家的灭门惨案有着莫大的关联，最终，为正义而战擎苍在一次次决战中更上一层楼，正面击败了幕后主使铁面人，带着妻子蓝羽儿重新踏上了寻医问诊之路。

明朝天启年间。出身卑微的殷影织遇到一个存在上千年的刺客组织暗影会，被告知自己身上流着刺客之王的血，而自己的父亲被人杀害。暗影会要将殷影织训练成超级刺客。要他为父报仇。谁知这本身就是天大的阴谋。